2013 年 2 月 14, 15 日

2013 年 1 月 11 日
HGC 利用者各位
東京大学医科学研究所
ヒトゲノム解析センター
スーパーコンピュータ室

この度「統計処理言語 R 講習会」と題しまして、当センターで利用可能な
統計処理言語 R についての講習会 (講義及び実習) を開催いたします。

講師には、理研横浜研究所 オミックス基盤研究領域 LSA
システム構築グループ プロジェクトディレクター代理をされている
Carsten Daub 博士をお招きします。
講義は英語ですが、日本人にも聴き取りやすいものです。

フリーソフトである統計処理言語 R は、科学分野で多くの研究者に利用
されています。基礎的な統計処理だけでなく先進的な統計技術を用いた
幅広い機能が提供され、それらのグラフィカル描画をも簡便に実現している
高レベルな機構を備えた統計プログラム言語です。

このたびの 2 日間の講習会は、統計処理言語 R に関する基礎的な入門に
なります。基本的な統計概念の説明に加え、参加者が講習会の中で取り上
げられた課題を自ら実際に実行していく実習を重視します。本講習会では、
参加者が自身の研究において、本講習で学習した知識をすぐに実践できる
ようになることに主眼を置いています。

日程と内容は下記の通りです。皆様のご参加をお待ちしています。

日時:
2 月 14 日 (木) 10:00 〜 18:00
2 月 15 日 (金) 10:00 〜 18:00

※ 2 日間がセットになった講習のため、1 日だけの参加はご遠慮ください。
※ 途中、昼食休憩と数回の休憩がございます。

会場: ヒトゲノム解析センター 4 階 セミナー室

対象: ヒトゲノム解析センター計算機システム利用者または R の利用者

内容: 統計処理言語 R の講義および実習

※ 本講習会は英語による講義です。

○ 申込方法
事前のお申し込みは、下記フォーマットに必要事項をご記入の上、
2 月 13 日 (水) 17:00 までに E-mail にてお願いいたします。
本講習会では、実習用パソコンの数に制限がありますので、参加者は
先着 35 名に限らせていただきます。※実習用パソコンは MacBook です。
講習会にはご自身のパソコンをお持ちいただくことも可能ですが、
ネットワークセキュリティ誓約書にサインをいただく必要があります。
また、ご自身のパソコンをご使用になる場合は、あらかじめ
統計処理言語 R をインストールしておいてください。
http://www.r-project.org/
インストール後、R を起動し以下の実行をお願いいたします。
> install.packages("gplots")
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("edgeR")

なお、本講習会についてご要望がございましたら、お申し込みの際にご記入を
お願いいたします。

E-mail: hgc-lect at hgc. jp

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「統計処理言語 R 講習会 ( 2 月 14 日 、2 月 15 日 )」に参加します。

氏名:
所属:
E-mail:
TEL:
ご要望:

以下のアンケートにお答えください。

* UNIX や Linux の利用経験について ( ) ※ a〜d でお答えください
a. 利用経験があり、基本的なコマンドを使える (ls, cd, export 等)
b. 利用経験はあるが、コマンドはあまり知らない
c. 利用経験はないが、今後利用したいと思っている
d. 利用経験はなく、今後も利用することはない

* R の利用経験について ( ) ※ a〜d でお答えください (複数可)
a. UNIX や Linux 版の利用経験がある
b. Windows 版の利用経験がある
c. Mac 版の利用経験がある
d. 利用経験はない

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【R に関する推薦図書】
1. The R website and their manuals and tutorials,
http://www.r-project.org/
2. Michel J. Crawley, Statistics: An Introduction using R, Wiley
3. Peter Dalgaard, Introductory Statistics with R, Springer

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NOTICE

January 11, 2013

We will give a training course, "Short introduction to the statistical
language R" in the following way:

Date:
10:00 - 18:00 February 14, 2013
10:00 - 18:00 February 15, 2013
* This course is a two-day course, so you can not attend just one day.

Place: Human Genome Center, 4F Seminar Room

Lecturer: Carsten O. Daub, PhD
Deputy Project Director, LSA System Development Group
Omics Science Center (OSC)
RIKEN Yokohama Institute

Target: all people who want to use R in their own research

Contents: introduction to the statistical language R
(lecture and practice)

* This course will be given in English.

Abstract:
The freely available statistical language R gained a lot of popularity in
the scientific community over the last years.
R provides a wide range of functionalities from graphical visualization
over basic and advanced statistical techniques to being the framework of a
high level statistical programming language.

This two day course gives a basic introduction into the freely available
and frequently used statistical language R. Basic statistical concepts are
briefly reviewed with the focus on the application of these concepts.
The course is conducted with a strong practical 'hands-on' component where
the students carry out the discussed exercises during the course.
The main goal of this course is to enable the students to immediately
employ the acquired knowledge for their research.

For Application, please fill the following form and send it by E-mail by
17:00 P.M. February 13.
This course has a limit of 35 participants because of the number of
personal computers we have. Our personal computers are MacBook.

If you wish to use your own personal computer in the course,
you have to install the statistical language R in advance.
http://www.r-project.org/
After installation of R, please install a package.
> install.packages("gplots")
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("edgeR")
In addition, you will need to agree to the Terms of Use of the network of
Human Genome Center.

You may add your specific requests, if any.

E-mail: hgc-lect at hgc. jp

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I would like to attend the course on Feb 14 and 15.

Name:
Division:
E-mail:
TEL:
Proposals or requests:

*** Please answer the following questionnaire ***

* Experience in using UNIX/Linux ( )
Please choose one from "a" to "d".
a. I know UNIX/Linux and can use its basic commands. (ls, cd, export,
etc)
b. I have heard of UNIX/Linux but cannot use its basic commands well.
c. I have not used UNIX/Linux but want to use it in the future.
d. I have not used UNIX/Linux nor will use it in the future.

* Experience in using R ( )
Please choose any from "a" to "d" (multiple answers are allowed)
a. I have used R on UNIX/Linux.
b. I have used R on Windows.
c. I have used R on Mac.
d. I have not used R at all.

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Recommended literature:
1. The R website and their manuals and tutorials,
http://www.r-project.org/
2. Michel J. Crawley, Statistics: An Introduction using R, Wiley
3. Peter Dalgaard, Introductory Statistics with R, Springer

Supercomputing Services
Human Genome Center
03-5449-5620
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